Insigne homologué sous le n° A-1080.
Les trois escadrilles constitutives sont la SAL 19 (Le Bougnat), la BR 104 (Les Turcos), anciennement attribuées au GBM II/52 et la BR 111 (Cygne) du GR I/52. Ces insignes ne sont pas portés par les aéronefs.
Le Franche-Comté a été initialement (septembre 1943 à septembre 1944) le Groupe de Bombardement Moyen II/52, devenant GT II/52 le 1er janvier 1946, puis GT II/62 le 1er juillet 1947 et ET 4/61 le 1er novembre 1955. Il devient escadron de transport 2/61 le 1er décembre 1956.
Le 2/61 Franche-Comté a été mis en sommeil le 3 juin 2022 sur la base aérienne 123 d’Orléans-Bricy, où il était basé depuis 1955.
De décembre 1987 à juin 2022, l’ET 2/61 a volé sur Lockheed C-130H Hercules.
De 1969 à décembre 1987, le Franche-Comté a volé sur Transall C-160.
D’octobre 1956 à 1969, le Franche-Comté a volé sur Noratlas.
Auparavant, le Franche-Comté a volé sur Dakota, Junker 52, Martin B-26 Marauder.